Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms