Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PCGF3Q3KNV8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms