Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCK2Q16822 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms