Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NRF1Q16656 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NRF1Q16656 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms