Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRADDQ15628 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms