Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MELKQ14680 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MELKQ14680 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MELKQ14680 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MELKQ14680 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms