Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PKP1Q13835 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PKP1Q13835 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PKP1Q13835 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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PKP1Q13835 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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PKP1Q13835 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PKP1Q13835 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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