Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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TUBA3CQ13748 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBA3CQ13748 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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