Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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