Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PMS2P11Q13670 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms