Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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