Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRSQ13332 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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PTPRSQ13332 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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PTPRSQ13332 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRSQ13332 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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PTPRSQ13332 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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