Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GPS1Q13098 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPS1Q13098 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms