Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXD4Q12950 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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