Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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