Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC2Q02487 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms