Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARF3P61204 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARF3P61204 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARF3P61204 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms