Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP3P57721 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms