Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DAP3P51398 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DAP3P51398 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms