Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms