Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX2P28328 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms