Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNCP24821 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNCP24821 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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