Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms