Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK1P06493 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK1P06493 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDK1P06493 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDK1P06493 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDK1P06493 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK1P06493 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK1P06493 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDK1P06493 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms