Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBDO15205 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBDO15205 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBDO15205 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBDO15205 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBDO15205 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBDO15205 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBDO15205 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms