Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SNPHO15079 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNPHO15079 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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