Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms