Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC00312Q9Y6C7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00312Q9Y6C7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms