Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TUBE1Q9UJT0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms