Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms