Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4Q9P0V3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4Q9P0V3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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