Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFY2Q9P0M6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms