Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6BQ9NRW1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6BQ9NRW1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms