Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMURF2Q9HAU4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms