Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR1EQ9GZS1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms