Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TDRD1Q9BXT4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms