Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms