Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC114Q96M63 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms