Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00269Q8N2A0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms