Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms