Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATG16L1Q676U5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms