Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBM48Q5RL73 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM48Q5RL73 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBM48Q5RL73 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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