Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFT2D3Q587I9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms