Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB39AQ14964 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms