Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPARCL1Q14515 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPARCL1Q14515 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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