Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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