Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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APOFQ13790 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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