Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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