Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TOP3AQ13472 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TOP3AQ13472 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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