Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSPB3Q12988 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms